Als secretaris-generaal van de UNASUR, eerste uitdaging Kirchner was het herstel van de diplomatieke betrekkingen tussen Venezuela en Colombia. Ook geconfronteerd met een poging tot een staatsgreep in Ecuador.

Voormalig president Nestor Kirchner complexe uitdagingen tijdens zijn korte ambtstermijn als hoofd van het secretariaat-generaal van de Unie van Zuid-Amerikaanse Naties (UNASUR) en de confrontatie tussen Venezuela en Colombia en de poging tot staatsgreep in Ecuador.
Kirchner trad integratie forum op 4 mei dit jaar, tijdens de buitengewone top in de plaats van Los Cardales.
Zijn kandidatuur werd versterkt door de president van Ecuador, Rafael Correa, en had de steun van de Braziliaanse president Luiz Lula da Silva en de Venezolaanse president Hugo Chavez ontmoet weerstand in de Uruguayaanse overheid, die Kirchner had veto uitgesproken voor het confl ict bilaterale met Argentinië over de Botnia pulpfabriek in Fray Bentos.
De plaatsvervangend won de goedkeuring van Montevideo Jose Mujica neemt het voorzitterschap van Uruguay, in een tijd waarin de UNASUR gaf manier om een Zuid-Amerikaanse Raad Defensie om een protocol vast te stellen over vrede, veiligheid en regionale samenwerking.
Kirchner fi guur was de sleutel tot het oplossen van de eerste grote omwentelingen van het blok, als Venezuela en Colombia diplomatieke betrekkingen verbrak op 23 juli als gevolg van de beëindiging van de regering van Alvaro Uribe in de aanwezigheid van FARC-guerrilla in het Venezolaanse grondgebied met de vermeende Chavez toestemming.
De escalatie van het confl ict dwong hem om te reizen eerste maand na Caracas, waar hij een ontmoeting met Chavez, en vervolgens naar Bogota om de situatie met de onlangs aangenomen Juan Manuel Santos onschadelijk te maken.
Op 30 september van UNASUR werd opnieuw getest, dit keer voor de poging tot staatsgreep in Ecua Dor, en snel een oproep aan de voorzitters Kirchner in Buenos Aires blok toegestaan een sterk signaal naar de regeringen van de regio breken tegen de institutionele orde.
In deze buitengewone top van 1 oktober hebben de staatshoofden besloten tot een aanvullend protocol bij het Verdrag tot oprichting van de UNASUR aan de te nemen "democratische clausule."
Het protocol zal worden fi rmed op 26 november in Guyana, waar de volgende benoeming van Kirchner zijn, was voor de UNASUR